Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
H3BQV1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
H3BQV1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
H3BQV1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
H3BQV1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
H3BQV1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
H3BQV1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
H3BQV1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
H3BQV1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
H3BQV1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
H3BQV1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
H3BQV1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
H3BQV1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
H3BQV1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
H3BQV1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
H3BQV1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
H3BQV1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
H3BQV1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
H3BQV1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
H3BQV1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
H3BQV1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
H3BQV1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
H3BQV1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
H3BQV1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
H3BQV1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
H3BQV1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
H3BQV1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
H3BQV1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
H3BQV1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
H3BQV1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
H3BQV1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
H3BQV1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
H3BQV1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
H3BQV1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
H3BQV1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
H3BQV1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
H3BQV1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
H3BQV1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
H3BQV1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
H3BQV1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
H3BQV1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
H3BQV1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
H3BQV1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
H3BQV1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
H3BQV1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
H3BQV1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
H3BQV1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
H3BQV1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
H3BQV1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
H3BQV1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
H3BQV1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
H3BQV1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
H3BQV1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
H3BQV1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
H3BQV1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
H3BQV1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
H3BQV1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
H3BQV1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
H3BQV1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
H3BQV1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
H3BQV1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
H3BQV1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
H3BQV1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
H3BQV1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
H3BQV1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
H3BQV1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
H3BQV1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
H3BQV1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
H3BQV1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
H3BQV1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
H3BQV1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
H3BQV1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
H3BQV1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
H3BQV1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
H3BQV1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
H3BQV1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
H3BQV1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
H3BQV1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
H3BQV1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
H3BQV1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25■■□□□ 1.59
H3BQV1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
H3BQV1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
H3BQV1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25■■□□□ 1.59
H3BQV1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
H3BQV1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
H3BQV1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25■■□□□ 1.59
H3BQV1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
H3BQV1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
H3BQV1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
H3BQV1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
H3BQV1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
H3BQV1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
H3BQV1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
H3BQV1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
H3BQV1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
H3BQV1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
H3BQV1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H3BQV1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H3BQV1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H3BQV1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms