Protein–RNA interactions for Protein: H3BQF6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQF6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BQF6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BQF6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BQF6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BQF6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BQF6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BQF6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BQF6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BQF6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BQF6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BQF6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BQF6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BQF6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BQF6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BQF6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BQF6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BQF6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
H3BQF6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
H3BQF6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H3BQF6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H3BQF6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H3BQF6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
H3BQF6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H3BQF6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H3BQF6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H3BQF6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H3BQF6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H3BQF6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H3BQF6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H3BQF6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H3BQF6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H3BQF6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H3BQF6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H3BQF6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H3BQF6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H3BQF6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H3BQF6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H3BQF6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H3BQF6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H3BQF6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H3BQF6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H3BQF6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H3BQF6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H3BQF6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H3BQF6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H3BQF6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H3BQF6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H3BQF6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H3BQF6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H3BQF6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H3BQF6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H3BQF6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H3BQF6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H3BQF6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H3BQF6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H3BQF6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H3BQF6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BQF6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BQF6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BQF6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BQF6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BQF6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BQF6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BQF6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BQF6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BQF6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BQF6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BQF6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BQF6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BQF6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BQF6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BQF6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BQF6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BQF6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BQF6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BQF6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BQF6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BQF6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BQF6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BQF6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BQF6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BQF6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BQF6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BQF6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BQF6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BQF6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
H3BQF6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
H3BQF6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
H3BQF6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
H3BQF6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
H3BQF6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3BQF6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3BQF6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3BQF6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3BQF6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3BQF6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3BQF6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
H3BQF6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3BQF6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3BQF6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms