Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
B4DXG7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
B4DXG7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
B4DXG7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
B4DXG7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
B4DXG7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
B4DXG7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
B4DXG7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
B4DXG7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
B4DXG7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
B4DXG7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
B4DXG7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
B4DXG7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
B4DXG7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
B4DXG7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
B4DXG7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
B4DXG7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
B4DXG7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
B4DXG7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
B4DXG7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
B4DXG7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
B4DXG7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
B4DXG7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
B4DXG7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
B4DXG7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
B4DXG7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
B4DXG7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
B4DXG7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
B4DXG7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
B4DXG7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
B4DXG7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
B4DXG7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
B4DXG7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
B4DXG7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
B4DXG7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
B4DXG7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
B4DXG7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
B4DXG7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
B4DXG7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
B4DXG7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
B4DXG7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
B4DXG7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
B4DXG7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
B4DXG7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
B4DXG7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
B4DXG7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
B4DXG7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
B4DXG7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
B4DXG7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
B4DXG7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
B4DXG7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
B4DXG7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
B4DXG7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
B4DXG7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
B4DXG7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
B4DXG7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
B4DXG7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
B4DXG7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
B4DXG7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
B4DXG7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
B4DXG7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
B4DXG7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
B4DXG7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
B4DXG7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
B4DXG7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
B4DXG7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
B4DXG7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
B4DXG7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
B4DXG7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
B4DXG7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
B4DXG7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
B4DXG7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
B4DXG7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
B4DXG7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
B4DXG7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
B4DXG7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
B4DXG7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
B4DXG7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
B4DXG7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
B4DXG7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
B4DXG7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
B4DXG7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
B4DXG7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
B4DXG7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
B4DXG7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
B4DXG7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
B4DXG7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
B4DXG7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
B4DXG7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
B4DXG7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
B4DXG7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
B4DXG7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
B4DXG7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
B4DXG7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
B4DXG7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
B4DXG7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
B4DXG7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
B4DXG7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
B4DXG7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
B4DXG7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms