Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEURL1BA8MQ27 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEURL1BA8MQ27 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEURL1BA8MQ27 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms