Protein–RNA interactions for Protein: A8K0S8

MEIS3P2, Putative homeobox protein Meis3-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P2A8K0S8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEIS3P2A8K0S8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEIS3P2A8K0S8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms