Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP27XA6NNY8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms