Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC85CA6NKD9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms