Protein–RNA interactions for Protein: A6NFR6

C5orf60, Putative uncharacterized protein C5orf60, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf60A6NFR6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
C5orf60A6NFR6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C5orf60A6NFR6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms