Protein–RNA interactions for Protein: A6NFQ2

TCAF2, TRPM8 channel-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF2A6NFQ2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCAF2A6NFQ2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms