Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN8

Putative ubiquitin-like protein FUBI-like protein ENSP00000310146, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NDN8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A6NDN8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A6NDN8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A6NDN8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
A6NDN8 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
A6NDN8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A6NDN8 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A6NDN8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A6NDN8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
A6NDN8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A6NDN8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A6NDN8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A6NDN8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A6NDN8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A6NDN8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A6NDN8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A6NDN8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A6NDN8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
A6NDN8 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A6NDN8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A6NDN8 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A6NDN8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
A6NDN8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
A6NDN8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
A6NDN8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
A6NDN8 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A6NDN8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A6NDN8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A6NDN8 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A6NDN8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A6NDN8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A6NDN8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A6NDN8 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A6NDN8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A6NDN8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A6NDN8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A6NDN8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
A6NDN8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A6NDN8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A6NDN8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A6NDN8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A6NDN8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A6NDN8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A6NDN8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A6NDN8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A6NDN8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A6NDN8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A6NDN8 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A6NDN8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A6NDN8 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A6NDN8 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A6NDN8 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NDN8 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NDN8 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NDN8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NDN8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NDN8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NDN8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NDN8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NDN8 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NDN8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NDN8 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NDN8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NDN8 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NDN8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NDN8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NDN8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NDN8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NDN8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NDN8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NDN8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NDN8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A6NDN8 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NDN8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NDN8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NDN8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NDN8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NDN8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NDN8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NDN8 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NDN8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NDN8 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NDN8 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NDN8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NDN8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NDN8 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NDN8 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NDN8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NDN8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NDN8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NDN8 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NDN8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NDN8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NDN8 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NDN8 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NDN8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NDN8 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NDN8 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NDN8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NDN8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms