Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms