Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PALM3A6NDB9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PALM3A6NDB9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms