Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS37CA5D8V6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS37CA5D8V6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms