Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRAMEF22A3QJZ6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms