Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0U1RQF3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0U1RQF3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms