Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6F4

TRBV21OR9-2, T-cell receptor beta variable 21/OR9-2 (pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
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TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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TRBV21OR9-2A0A075B6F4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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TRBV21OR9-2A0A075B6F4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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TRBV21OR9-2A0A075B6F4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
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TRBV21OR9-2A0A075B6F4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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TRBV21OR9-2A0A075B6F4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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TRBV21OR9-2A0A075B6F4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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TRBV21OR9-2A0A075B6F4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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TRBV21OR9-2A0A075B6F4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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TRBV21OR9-2A0A075B6F4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBV21OR9-2A0A075B6F4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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