Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 UBE2G1-201ENST00000396981 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 SLFNL1-202ENST00000359345 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 GBP1P1-201ENST00000394662 1740 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 CCL24-201ENST00000222902 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 IFNA6-201ENST00000259555 704 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 RN7SKP176-201ENST00000363673 318 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 ITLN2-201ENST00000368029 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 OOEP-201ENST00000370359 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 CYTOR-202ENST00000409054 1096 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 LINC01044-201ENST00000413637 657 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 FAM238B-202ENST00000423917 1220 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 AC006987.2-201ENST00000434709 527 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 AC079154.1-201ENST00000438816 542 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 AL157413.1-201ENST00000458461 823 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 CDHR4-205ENST00000487256 1017 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 PDLIM5-208ENST00000504489 538 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 RBPMS-205ENST00000517860 1076 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 NDRG1-207ENST00000518066 560 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 AC008750.2-201ENST00000526996 627 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 RPL37A-212ENST00000600880 425 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 FXYD3-207ENST00000604255 780 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 AL157791.2-201ENST00000604758 478 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 Metazoa_SRP.151-201ENST00000616313 273 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 Metazoa_SRP.97-201ENST00000618280 304 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 NCS1-203ENST00000630865 1092 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 ARMCX3-201ENST00000341189 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 CAMK2B-209ENST00000395749 4447 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 SMIM5-202ENST00000537494 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 IL1RAP-211ENST00000439062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 YIPF1-202ENST00000371399 1503 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 CTAGE5-202ENST00000280083 3860 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 TCF7L2-223ENST00000629706 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 SETD4-207ENST00000399215 4272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 SERP1-203ENST00000479209 3934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 JMJD7-PLA2G4B-201ENST00000342159 2966 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 SYS1-201ENST00000243918 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 AC015818.9-201ENST00000591705 4582 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 PCNA-201ENST00000379143 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 USP14-202ENST00000383589 2168 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 DFFB-205ENST00000378209 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 CWC22-202ENST00000410053 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 VPS45-211ENST00000535106 2695 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 DPY19L2P1-202ENST00000454445 2909 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 HYPK-201ENST00000406925 4777 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 PNPLA6-220ENST00000600737 4195 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 PLEKHG5-205ENST00000377740 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 RBAK-201ENST00000353796 4125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 WDR47-201ENST00000357672 4144 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 CLIP3-201ENST00000360535 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 OPTC-201ENST00000367222 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 ATAT1-205ENST00000376483 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 ZNF438-204ENST00000413025 3106 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 SEC61A1-203ENST00000464451 1871 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 FAM90A3P-201ENST00000506444 1395 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 FAM90A4P-201ENST00000509856 1395 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 FAM90A18P-201ENST00000527117 1395 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 FAM90A20P-201ENST00000528221 1395 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 FAM90A10P-201ENST00000530206 1395 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 FAM90A19P-201ENST00000533611 1395 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 NFYB-201ENST00000240055 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 AC090114.2-201ENST00000608477 7054 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 AC091948.1-201ENST00000501695 2033 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 MARCH5-201ENST00000358935 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 PSMD11-201ENST00000261712 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 IGLV4-60-201ENST00000390284 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 PTRH2-201ENST00000393038 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 KRT41P-201ENST00000393988 1293 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 FAM238A-201ENST00000412114 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 AL356583.3-201ENST00000412354 417 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 AL162595.1-201ENST00000429227 868 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 PTPN2P2-201ENST00000433704 1024 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 AC005042.2-201ENST00000449526 510 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 AC138956.2-201ENST00000512934 528 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 AC022733.2-201ENST00000520487 531 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 CETN3-203ENST00000522083 1026 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 CETN3-204ENST00000522565 867 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 TRIM29-213ENST00000529044 1233 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 EIF5A-207ENST00000572815 811 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 MIR6871-201ENST00000613433 56 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 AC072062.1-201ENST00000617699 351 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 PASK-216ENST00000629419 216 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 AC073264.4-201ENST00000638055 623 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 TNNT3-216ENST00000641119 941 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 NBR1-205ENST00000589872 3097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PTPRJQ12913 AFF2-202ENST00000342251 7313 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms