Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 ZNF398-201ENST00000426851 5268 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPRJQ12913 RUBCNL-208ENST00000429979 3979 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPRJQ12913 SYN3-202ENST00000358763 3126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPRJQ12913 RMI2-202ENST00000572173 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPRJQ12913 FAN1-203ENST00000561607 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PTPRJQ12913 TMBIM6-227ENST00000552699 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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PTPRJQ12913 EZR-203ENST00000392177 2933 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPRJQ12913 SLC36A4-201ENST00000326402 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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PTPRJQ12913 TJP2-201ENST00000348208 4058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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PTPRJQ12913 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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PTPRJQ12913 LAS1L-203ENST00000374811 2439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPRJQ12913 RFC3-201ENST00000380071 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPRJQ12913 SPACA5-201ENST00000304355 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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PTPRJQ12913 AL359918.2-201ENST00000412311 497 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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PTPRJQ12913 LINC01824-201ENST00000436082 528 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPRJQ12913 AC018511.1-201ENST00000436608 380 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPRJQ12913 TEPP-202ENST00000441824 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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PTPRJQ12913 AL450998.3-203ENST00000453804 645 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPRJQ12913 NUP58-206ENST00000463407 6360 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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PTPRJQ12913 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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PTPRJQ12913 AC120498.5-201ENST00000561757 299 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPRJQ12913 AP000894.2-203ENST00000580612 439 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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PTPRJQ12913 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPRJQ12913 MIR7704-201ENST00000610524 59 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPRJQ12913 C17orf98-201ENST00000614158 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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PTPRJQ12913 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PTPRJQ12913 ENDOU-201ENST00000229003 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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PTPRJQ12913 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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PTPRJQ12913 NVL-201ENST00000281701 3123 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PTPRJQ12913 CEP89-204ENST00000590597 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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PTPRJQ12913 USP3-202ENST00000380324 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PTPRJQ12913 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PTPRJQ12913 LINC01070-201ENST00000561786 2829 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PTPRJQ12913 CEBPZOS-203ENST00000397226 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PTPRJQ12913 UGDH-AS1-201ENST00000504032 2787 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PTPRJQ12913 DNAI2-206ENST00000582036 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PTPRJQ12913 NFKBIA-208ENST00000557140 1400 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
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