| PTPRJ | Q12913 | ZNF398-201 | ENST00000426851 | 5268 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.98 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | RUBCNL-208 | ENST00000429979 | 3979 nt | APPRIS P3 TSL 5 BASIC | 12.98 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SYN3-202 | ENST00000358763 | 3126 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 12.98 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | RMI2-202 | ENST00000572173 | 1865 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.98 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | FAN1-203 | ENST00000561607 | 2690 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.98 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TMBIM6-227 | ENST00000552699 | 2964 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 12.97 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PCDHB2-201 | ENST00000194155 | 4126 nt | APPRIS P1 BASIC | 12.97 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | EZR-203 | ENST00000392177 | 2933 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 12.97 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SLC36A4-201 | ENST00000326402 | 6012 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.97 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | BTBD10-201 | ENST00000278174 | 2504 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 12.97 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TJP2-201 | ENST00000348208 | 4058 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 12.97 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | LRRK2-202 | ENST00000343742 | 4740 nt | TSL 5 BASIC | 12.97 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SMAD1-215 | ENST00000515385 | 2085 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 12.97 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC092135.1-201 | ENST00000623398 | 2059 nt | BASIC | 12.97 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | POTEI-203 | ENST00000631234 | 2072 nt | TSL 2 BASIC | 12.97 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | LAS1L-203 | ENST00000374811 | 2439 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 12.97 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | RFC3-201 | ENST00000380071 | 2402 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.97 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SPACA5-201 | ENST00000304355 | 648 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.97 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | RNU12-201 | ENST00000362512 | 150 nt | BASIC | 12.97 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | RPL15P3-201 | ENST00000391491 | 615 nt | BASIC | 12.97 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AP001610.1-201 | ENST00000411427 | 1116 nt | TSL 5 BASIC | 12.97 | □□□□□ -0.33 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | LINC01824-201 | ENST00000436082 | 528 nt | TSL 4 BASIC | 12.97 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC018511.1-201 | ENST00000436608 | 380 nt | TSL 5 BASIC | 12.97 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TEPP-202 | ENST00000441824 | 998 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 12.97 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC114495.2-201 | ENST00000452686 | 437 nt | BASIC | 12.97 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AL450998.3-203 | ENST00000453804 | 645 nt | TSL 3 BASIC | 12.97 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | NUP58-206 | ENST00000463407 | 6360 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.97 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | GAPDHP76-201 | ENST00000512278 | 976 nt | BASIC | 12.97 | □□□□□ -0.33 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | AC120498.5-201 | ENST00000561757 | 299 nt | BASIC | 12.97 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AP000894.2-203 | ENST00000580612 | 439 nt | TSL 3 BASIC | 12.97 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MIR5193-201 | ENST00000584510 | 109 nt | BASIC | 12.97 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | BIRC5-211 | ENST00000592734 | 386 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.97 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MIR7704-201 | ENST00000610524 | 59 nt | BASIC | 12.97 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | C17orf98-201 | ENST00000614158 | 632 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 12.97 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | DNAJB5-AS1-201 | ENST00000626300 | 749 nt | TSL 3 BASIC | 12.97 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | LINC00969-286 | ENST00000627297 | 708 nt | TSL 5 BASIC | 12.97 | □□□□□ -0.33 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | GOLGA6L4-202 | ENST00000422563 | 4155 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 12.97 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ENDOU-201 | ENST00000229003 | 2332 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.97 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | KBTBD3-205 | ENST00000531837 | 2682 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.97 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | LTF-201 | ENST00000231751 | 2979 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 12.97 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SYNGAP1-208 | ENST00000629380 | 9862 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 12.97 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TNPO2-218 | ENST00000592287 | 2914 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 12.97 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PARD6B-201 | ENST00000371610 | 4615 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.97 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | GNA13-202 | ENST00000541118 | 1502 nt | TSL 2 BASIC | 12.97 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ENOPH1-204 | ENST00000610545 | 1542 nt | TSL 5 BASIC | 12.97 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ITPR2-202 | ENST00000381340 | 11405 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.97 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | LITAF-221 | ENST00000622633 | 2467 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.97 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | IL1RL2-203 | ENST00000441515 | 1484 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.97 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | FDXACB1-201 | ENST00000260257 | 2789 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.97 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC022730.4-201 | ENST00000520259 | 2367 nt | TSL 2 BASIC | 12.97 | □□□□□ -0.33 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | COG6-204 | ENST00000455146 | 3563 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.97 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | HDAC8-214 | ENST00000439122 | 2338 nt | TSL 2 BASIC | 12.97 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ITGB8-201 | ENST00000222573 | 8751 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.97 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | DLGAP1-203 | ENST00000400147 | 5258 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | DLGAP1-206 | ENST00000400155 | 5257 nt | TSL 2 BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | COLGALT1-201 | ENST00000252599 | 3704 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | NVL-201 | ENST00000281701 | 3123 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CEP89-204 | ENST00000590597 | 1340 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | BRWD1-201 | ENST00000333229 | 10141 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | STXBP1-221 | ENST00000637953 | 3925 nt | TSL 5 BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | WFS1-201 | ENST00000226760 | 3640 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PRIMPOL-209 | ENST00000512834 | 2174 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | EHD1-213 | ENST00000621096 | 3336 nt | TSL 5 BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MED24-212 | ENST00000501516 | 3037 nt | TSL 5 BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC073834.1-201 | ENST00000357045 | 590 nt | TSL 4 BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | HDAC8-201 | ENST00000373554 | 833 nt | TSL 2 BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | LSM2-208 | ENST00000375661 | 876 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | IGHV7-81-201 | ENST00000390639 | 405 nt | APPRIS P1 BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TTC32-202 | ENST00000402414 | 735 nt | TSL 5 BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MAPT-207 | ENST00000420682 | 1239 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | LINC01297-202 | ENST00000453395 | 624 nt | TSL 5 BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | HFE-209 | ENST00000461397 | 1045 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC136632.1-201 | ENST00000477964 | 591 nt | BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC027373.1-201 | ENST00000564694 | 1142 nt | BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CNN2-207 | ENST00000565096 | 2109 nt | TSL 2 BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | FGF11-205 | ENST00000575398 | 990 nt | TSL 2 BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC005336.1-201 | ENST00000585431 | 1243 nt | BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC010422.2-201 | ENST00000593554 | 635 nt | TSL 3 BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.33 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | PDLIM2-218 | ENST00000614502 | 599 nt | TSL 2 BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PRSS2-206 | ENST00000633969 | 852 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC122129.1-201 | ENST00000354746 | 1815 nt | BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | GIMAP5-207 | ENST00000498181 | 1835 nt | APPRIS P1 TSL 4 BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SEMA6D-207 | ENST00000536845 | 3754 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | RAE1-209 | ENST00000527947 | 1503 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | EIF4G1-205 | ENST00000382330 | 5129 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | VPS45-212 | ENST00000611412 | 2064 nt | TSL 5 BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | USP3-202 | ENST00000380324 | 2333 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | VDR-201 | ENST00000229022 | 4773 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | LINC01070-201 | ENST00000561786 | 2829 nt | TSL 2 BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CEBPZOS-203 | ENST00000397226 | 1499 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | UGDH-AS1-201 | ENST00000504032 | 2787 nt | TSL 2 BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.33 | | |
| PTPRJ | Q12913 | DNAI2-206 | ENST00000582036 | 2240 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.34 | | |
| PTPRJ | Q12913 | NFKBIA-208 | ENST00000557140 | 1400 nt | TSL 5 BASIC | 12.96 | □□□□□ -0.34 | | |