Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00312Q9Y6C7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00312Q9Y6C7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms