Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SRPRBQ9Y5M8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRPRBQ9Y5M8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms