Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5H7

PCDHA5, Protocadherin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA5Q9Y5H7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA5Q9Y5H7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA5Q9Y5H7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA5Q9Y5H7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA5Q9Y5H7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA5Q9Y5H7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA5Q9Y5H7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA5Q9Y5H7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA5Q9Y5H7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PCDHA5Q9Y5H7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCDHA5Q9Y5H7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHA5Q9Y5H7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHA5Q9Y5H7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHA5Q9Y5H7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHA5Q9Y5H7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHA5Q9Y5H7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHA5Q9Y5H7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHA5Q9Y5H7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHA5Q9Y5H7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHA5Q9Y5H7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHA5Q9Y5H7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHA5Q9Y5H7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHA5Q9Y5H7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHA5Q9Y5H7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHA5Q9Y5H7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHA5Q9Y5H7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms