Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FARP1Q9Y4F1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FARP1Q9Y4F1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FARP1Q9Y4F1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms