Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Q9Y3F1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Q9Y3F1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms