Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
THRAP3Q9Y2W1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
THRAP3Q9Y2W1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
THRAP3Q9Y2W1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
THRAP3Q9Y2W1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
THRAP3Q9Y2W1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
THRAP3Q9Y2W1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
THRAP3Q9Y2W1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
THRAP3Q9Y2W1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
THRAP3Q9Y2W1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
THRAP3Q9Y2W1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
THRAP3Q9Y2W1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
THRAP3Q9Y2W1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
THRAP3Q9Y2W1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
THRAP3Q9Y2W1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
THRAP3Q9Y2W1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
THRAP3Q9Y2W1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
THRAP3Q9Y2W1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
THRAP3Q9Y2W1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
THRAP3Q9Y2W1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
THRAP3Q9Y2W1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms