Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M5

KLHL20, Kelch-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL20Q9Y2M5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
KLHL20Q9Y2M5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL20Q9Y2M5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms