Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
FARSAQ9Y285 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms