Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX6

KIAA1024, UPF0258 protein KIAA1024, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1024Q9UPX6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIAA1024Q9UPX6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIAA1024Q9UPX6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIAA1024Q9UPX6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIAA1024Q9UPX6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIAA1024Q9UPX6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIAA1024Q9UPX6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIAA1024Q9UPX6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIAA1024Q9UPX6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIAA1024Q9UPX6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIAA1024Q9UPX6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KIAA1024Q9UPX6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KIAA1024Q9UPX6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KIAA1024Q9UPX6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KIAA1024Q9UPX6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIAA1024Q9UPX6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIAA1024Q9UPX6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIAA1024Q9UPX6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIAA1024Q9UPX6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIAA1024Q9UPX6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIAA1024Q9UPX6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIAA1024Q9UPX6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIAA1024Q9UPX6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIAA1024Q9UPX6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIAA1024Q9UPX6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIAA1024Q9UPX6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIAA1024Q9UPX6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms