Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULH4

LRFN2, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN2Q9ULH4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRFN2Q9ULH4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRFN2Q9ULH4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms