Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TUBE1Q9UJT0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms