Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TSR3Q9UJK0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSR3Q9UJK0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms