Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RIMS3Q9UJD0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms