Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLXNA1Q9UIW2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLXNA1Q9UIW2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLXNA1Q9UIW2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLXNA1Q9UIW2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PLXNA1Q9UIW2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLXNA1Q9UIW2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLXNA1Q9UIW2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLXNA1Q9UIW2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLXNA1Q9UIW2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PLXNA1Q9UIW2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms