Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ABCF2Q9UG63 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCF2Q9UG63 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCF2Q9UG63 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms