Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms