Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKD2L1Q9P0L9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKD2L1Q9P0L9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKD2L1Q9P0L9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKD2L1Q9P0L9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKD2L1Q9P0L9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKD2L1Q9P0L9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKD2L1Q9P0L9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKD2L1Q9P0L9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKD2L1Q9P0L9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKD2L1Q9P0L9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKD2L1Q9P0L9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKD2L1Q9P0L9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKD2L1Q9P0L9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKD2L1Q9P0L9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKD2L1Q9P0L9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKD2L1Q9P0L9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKD2L1Q9P0L9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKD2L1Q9P0L9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PKD2L1Q9P0L9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKD2L1Q9P0L9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKD2L1Q9P0L9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKD2L1Q9P0L9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKD2L1Q9P0L9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKD2L1Q9P0L9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKD2L1Q9P0L9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKD2L1Q9P0L9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKD2L1Q9P0L9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKD2L1Q9P0L9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKD2L1Q9P0L9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKD2L1Q9P0L9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKD2L1Q9P0L9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKD2L1Q9P0L9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKD2L1Q9P0L9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKD2L1Q9P0L9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKD2L1Q9P0L9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKD2L1Q9P0L9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKD2L1Q9P0L9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKD2L1Q9P0L9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKD2L1Q9P0L9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKD2L1Q9P0L9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKD2L1Q9P0L9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKD2L1Q9P0L9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PKD2L1Q9P0L9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKD2L1Q9P0L9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKD2L1Q9P0L9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKD2L1Q9P0L9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PKD2L1Q9P0L9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PKD2L1Q9P0L9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PKD2L1Q9P0L9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKD2L1Q9P0L9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 223.2 ms