Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC59Q9P031 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC59Q9P031 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms