Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNK4Q9NYG8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNK4Q9NYG8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNK4Q9NYG8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNK4Q9NYG8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNK4Q9NYG8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNK4Q9NYG8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNK4Q9NYG8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNK4Q9NYG8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNK4Q9NYG8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNK4Q9NYG8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNK4Q9NYG8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNK4Q9NYG8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNK4Q9NYG8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNK4Q9NYG8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNK4Q9NYG8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNK4Q9NYG8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNK4Q9NYG8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNK4Q9NYG8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNK4Q9NYG8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNK4Q9NYG8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNK4Q9NYG8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNK4Q9NYG8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNK4Q9NYG8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNK4Q9NYG8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNK4Q9NYG8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNK4Q9NYG8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNK4Q9NYG8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNK4Q9NYG8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNK4Q9NYG8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNK4Q9NYG8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNK4Q9NYG8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNK4Q9NYG8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNK4Q9NYG8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNK4Q9NYG8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNK4Q9NYG8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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KCNK4Q9NYG8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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KCNK4Q9NYG8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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KCNK4Q9NYG8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNK4Q9NYG8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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