Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY43

BARHL2, BarH-like 2 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL2Q9NY43 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BARHL2Q9NY43 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BARHL2Q9NY43 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BARHL2Q9NY43 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BARHL2Q9NY43 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BARHL2Q9NY43 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BARHL2Q9NY43 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BARHL2Q9NY43 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BARHL2Q9NY43 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms