Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY27

PPP4R2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R2Q9NY27 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PPP4R2Q9NY27 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP4R2Q9NY27 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms