Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL2

ARHGEF38, Rho guanine nucleotide exchange factor 38, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF38Q9NXL2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ARHGEF38Q9NXL2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms