Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLE1Q9NVX2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NLE1Q9NVX2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLE1Q9NVX2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLE1Q9NVX2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLE1Q9NVX2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLE1Q9NVX2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLE1Q9NVX2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLE1Q9NVX2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLE1Q9NVX2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLE1Q9NVX2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLE1Q9NVX2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLE1Q9NVX2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLE1Q9NVX2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NLE1Q9NVX2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NLE1Q9NVX2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLE1Q9NVX2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLE1Q9NVX2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLE1Q9NVX2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLE1Q9NVX2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLE1Q9NVX2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLE1Q9NVX2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLE1Q9NVX2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLE1Q9NVX2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLE1Q9NVX2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLE1Q9NVX2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLE1Q9NVX2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLE1Q9NVX2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLE1Q9NVX2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLE1Q9NVX2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLE1Q9NVX2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLE1Q9NVX2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLE1Q9NVX2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLE1Q9NVX2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLE1Q9NVX2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NLE1Q9NVX2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NLE1Q9NVX2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLE1Q9NVX2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLE1Q9NVX2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLE1Q9NVX2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NLE1Q9NVX2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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