Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SAMSN1Q9NSI8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms