Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS23

RASSF1, Ras association domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF1Q9NS23 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RASSF1Q9NS23 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RASSF1Q9NS23 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RASSF1Q9NS23 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RASSF1Q9NS23 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RASSF1Q9NS23 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RASSF1Q9NS23 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RASSF1Q9NS23 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RASSF1Q9NS23 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RASSF1Q9NS23 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RASSF1Q9NS23 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RASSF1Q9NS23 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RASSF1Q9NS23 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RASSF1Q9NS23 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RASSF1Q9NS23 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RASSF1Q9NS23 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RASSF1Q9NS23 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RASSF1Q9NS23 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RASSF1Q9NS23 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RASSF1Q9NS23 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RASSF1Q9NS23 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RASSF1Q9NS23 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RASSF1Q9NS23 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RASSF1Q9NS23 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RASSF1Q9NS23 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms