Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR96

TLR9, Toll-like receptor 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR9Q9NR96 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TLR9Q9NR96 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TLR9Q9NR96 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TLR9Q9NR96 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TLR9Q9NR96 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TLR9Q9NR96 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TLR9Q9NR96 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TLR9Q9NR96 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TLR9Q9NR96 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TLR9Q9NR96 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TLR9Q9NR96 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLR9Q9NR96 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLR9Q9NR96 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLR9Q9NR96 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLR9Q9NR96 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLR9Q9NR96 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLR9Q9NR96 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLR9Q9NR96 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLR9Q9NR96 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLR9Q9NR96 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLR9Q9NR96 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLR9Q9NR96 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLR9Q9NR96 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLR9Q9NR96 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLR9Q9NR96 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLR9Q9NR96 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLR9Q9NR96 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLR9Q9NR96 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLR9Q9NR96 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLR9Q9NR96 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLR9Q9NR96 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLR9Q9NR96 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLR9Q9NR96 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLR9Q9NR96 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLR9Q9NR96 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLR9Q9NR96 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLR9Q9NR96 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLR9Q9NR96 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLR9Q9NR96 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLR9Q9NR96 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLR9Q9NR96 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLR9Q9NR96 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLR9Q9NR96 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLR9Q9NR96 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TLR9Q9NR96 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms