Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RTN4Q9NQC3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms