Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC2

KCNK9, Potassium channel subfamily K member 9, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK9Q9NPC2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNK9Q9NPC2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNK9Q9NPC2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms