Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNCQ9H7C4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms