Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4W6

EBF3, Transcription factor COE3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF3Q9H4W6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EBF3Q9H4W6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EBF3Q9H4W6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EBF3Q9H4W6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms