Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2F9

CCDC68, Coiled-coil domain-containing protein 68, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC68Q9H2F9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC68Q9H2F9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC68Q9H2F9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC68Q9H2F9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC68Q9H2F9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC68Q9H2F9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC68Q9H2F9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC68Q9H2F9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC68Q9H2F9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC68Q9H2F9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC68Q9H2F9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC68Q9H2F9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC68Q9H2F9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC68Q9H2F9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC68Q9H2F9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC68Q9H2F9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC68Q9H2F9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC68Q9H2F9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC68Q9H2F9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC68Q9H2F9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC68Q9H2F9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC68Q9H2F9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC68Q9H2F9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC68Q9H2F9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC68Q9H2F9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC68Q9H2F9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC68Q9H2F9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC68Q9H2F9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC68Q9H2F9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC68Q9H2F9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC68Q9H2F9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms