Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTDSP1Q9GZU7 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms